El Centro de Ecología fue fundado el 1ro de septiembre de 1970 por cuatro jóvenes investigadores de aquel momento: Gilberto Rodríguez, eminente carcinólogo, quien dio grandes aportes al conocimiento de la diversidad biológica; Ernesto Medina, ecofisiólogo vegetal, quien dio aportes al conocimiento de la ecología vegetal tropical; Jorge Rabinovich con importantes aportes al conocimiento de la ecología de poblaciones; y Carlos Schubert, geólogo quien además de aportar importantes conocimientos en el área de la geología nacional, también brindó esa mirada del pasado, tan importante en las investigaciones ecológicas para poder explicar el presente. Desde su fundación, el centro de ecología ha tenido un enfoque integrador, no solamente desde el punto de vista de la ecología como una ciencia biológica, sino también como parte de las geociencias que con el avance de la tecnología y sobre todo el poder de computación, nos hemos adentrado en poder predecir el futuro a través de modelos y escenarios.